Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms