Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtcbQ99LF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms