Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EtfaQ99LC5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EtfaQ99LC5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms