Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmp1Q99KU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmp1Q99KU0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms