Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ciao1Q99KN2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms