Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms