Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms