Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pacsin3Q99JB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms