Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn16Q925N4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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