Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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