Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc1bQ920F6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1bQ920F6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms