Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms