Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd248Q91V98 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd248Q91V98 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms