Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn3Q91V61 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn3Q91V61 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms