Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms