Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itgbl1Q8VDV0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms