Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BbxQ8VBW5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms