Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ApobrQ8VBT6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms