Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk8Q8R3L8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk8Q8R3L8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms