Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TprkbQ8QZZ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms