Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms