Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OptnQ8K3K8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms