Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc12Q8K2L8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms