Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil3Q8K203 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms