Protein–RNA interactions for Protein: Q8K174

Tmem60, Transmembrane protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem60Q8K174 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem60Q8K174 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem60Q8K174 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem60Q8K174 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem60Q8K174 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem60Q8K174 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem60Q8K174 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem60Q8K174 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem60Q8K174 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem60Q8K174 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms