Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbrd1Q8K0B2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbrd1Q8K0B2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms