Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp2Q8CGR7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms