Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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