Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm9955Q8CEJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms