Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef8Q8CE24 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms