Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms