Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacnb2Q8CC27 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb2Q8CC27 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms