Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc60Q8C4J0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc60Q8C4J0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc60Q8C4J0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms