Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rft1Q8C3B8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rft1Q8C3B8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rft1Q8C3B8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms