Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0F9

Prss35, Inactive serine protease 35, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss35Q8C0F9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prss35Q8C0F9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prss35Q8C0F9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss35Q8C0F9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prss35Q8C0F9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prss35Q8C0F9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prss35Q8C0F9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prss35Q8C0F9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms