Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph4aQ8BYM7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph4aQ8BYM7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms