Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt3Q8BXF8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt3Q8BXF8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms