Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Skor1Q8BX46 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms