Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod1Q8BVA4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms