Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pggt1bQ8BUY9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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