Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd4Q8BSD4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd4Q8BSD4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjd4Q8BSD4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms