Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS47

9430097D07Rik, RIKEN cDNA 9430097D07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430097D07RikQ8BS47 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9430097D07RikQ8BS47 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9430097D07RikQ8BS47 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms