Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga3Q8BMI3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms