Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
D130040H23RikQ8BII3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms