Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca8Q8BHX3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdca8Q8BHX3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms