Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms