Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samm50Q8BGH2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms