Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sv2bQ8BG39 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sv2bQ8BG39 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sv2bQ8BG39 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms