Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Jmjd4Q8BFT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Jmjd4Q8BFT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Jmjd4Q8BFT6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms