Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap100Q80VN0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap100Q80VN0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap100Q80VN0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms